東平洲擁有全港最大的珊瑚分佈群落，總面積達1.8平方公里
隨廣闊的珊瑚群落外，東平洲亦是全港最龐大的海藻床，共紀錄得超過40個品種之多。
東平洲的海岸資源豐富, 擁有大部分重要的海洋生境如沙灘、石灘、珊瑚及海藻。其珊瑚群落在香港數一數二 ，常見的珊瑚品種包括十字牡丹珊瑚, 中華扁腦珊瑚等。
東平洲的海岸可找到形狀奇特的沉積 岩及其他地理特徵， 極具科學及教育價值 。
因地理環境關係，東平洲沿岸形成極具生態價值的潮池生境(Rock Pool)。